Instalación de servidor Thredds

The THREDDS Data Server (TDS) is a web server that provides metadata and data access for scientific datasets, using a variety of remote data access protocols.

https://www.unidata.ucar.edu/software/thredds/current/tds/

Requisitos previos

Instalamos Thredds 4.6.13 (release 19 de febrero de 2019) sobre máquina virtual con sistema operativo Ubuntu 16.0.4 LTS con los siguientes requisitos:

• JDK8
• Tomcat8
• Apache2 (para redireccionamiento de tráfico) o nginx

Para comprobar nuestra versión de Ubuntu tecleamos en una ventana de comandos:

cat /etc/issue

También debemos saber si nuestra máquina es de 32 o 64B:

uname -m

Instalar JDK8

Instalamos como administrador:

sudo apt-get update
sudo apt-get install openjdk-8-jre-headless

Comprobamos la instalación:

java -version

sudo update-alternatives --display java

Agregar la línea anterior permite que todos los usuarios en el sistema tengan acceso a la variable de entorno JAVA_HOME. Se debe recargar el archivo para aplicar los cambios:

source /etc/environment

echo $JAVA_HOME

Instalación de Tomcat8

Instalamos como administrador:

sudo apt-get install tomcat8 tomcat8-admin

Añadimos usuarios para el manejo del "manager-gui". Para ello modificamos el archivo tomcat-users.xml y ponemos lo siguiente (recordando descomentar el párrafo):

<tomcat-users>  
	<role rolename="manager-gui"/>  
    <user username="youUserName" password="yourPassword" roles="manager-gui"/>
</tomcat-users>

Ampliamos la memoria JAVA que usa Tomcat. Para ello añadimos -Xmx4096m a las opciones de JAVA_OPTS en el archivo /etc/default/tomcat8

Por el hecho de instalar sobre Tomcat, el arhivo  /usr/share/tomcat8/bin/catalina.sh apunta al archivo setenv.sh, que puede o no existir. Si no existe lo creamos en el mismo directorio y en él escribimos:

JAVA_OPTS="-server -Xmx4096m -Xms4096m"

Reiniciamos Tomcat:

sudo service tomcat8 restart

Comprobamos que el servicio está levantado introduciendo en el navegador web nuestra IP seguida del puerto 8080: http://localhost:8080

Instalar Thredds

Descargamos el fichero war:

sudo wget http://artifacts.unidata.ucar.edu/content/repositories/unidata-releases/edu/ucar/tds/4.6.13/tds-4.6.13.war

Y movemos el archivo war al directorio webapps dentro del Tomcat. Arrancamos el tomcat y a través del manager desplegamos el thredds. Aunque se haya desempaquetado el archivo war, el catálogo aún no es operativo.

Creamos un directorio que albergará datos propios del catálogo Thredds:

sudo mkdir /var/lib/tomcat8/content/thredds

Y cambiamos los permisos para dárselos a tomcat:

sudo chown -R tomcat8:tomcat8 content/

Copiamos todo el contenido del directorio /var/lib/tomcat8/webapps/thredds/WEB-INF/altContent al nuevo directorio creado content/thredds/

Y ahora indicamos esta nueva opción en tomcat. Modificamos el archivo /usr/share/tomcat8/bin/setenv.sh:

CONTENT_ROOT="-Dtds.content.root.path=/var/lib/tomcat8/content"
NORMAL="-d64 -Xmx4090m -Xms512m -server"
MAX_PERM_GEN="-XX:MaxPermSize=256m"
HEADLESS="-Djava.awt.headless=true"
JAVA_PREFS_SYSTEM_ROOT="-Djava.util.prefs.systemRoot=/var/lib/tomcat8/content/thredds/javaUtilPrefs -Djava.util.prefs.userRoot=/var/lib/tomcat8/content/thredds/javaUtilPrefs"
#
JAVA_OPTS="$CONTENT_ROOT $NORMAL $MAX_PERM_GEN $HEADLESS $JAVA_PREFS_SYSTEM_ROOT"

Reiniciamos Tomcat:

sudo service tomcat8 restart

Comprobamos que el servicio está levantado introduciendo en el navegador web nuestra IP:

http://localhost:8080/thredds